Seele organizuje zmasowany atak na NERV, próbując zniszczyć Evy, zanim Gendo uruchomi Trzecie Uderzenie i Projekt Dopełnienia Ludzkości.

Łowcy głów poszukują sprawcy ataku terrorystycznego, za którego wyznaczono wysoką nagrodę.

Konkluzja popularnej serii Neon Genesis Evangelion. Po zwycięstwie nad ostatnim Aniołem organizacja SEELE przystepuje do dokonania celu, w jakim pierwotnie stworzono ją i…