Agenci Mulder i Scully próbują uratować ludzkość przed śmiercionośną bronią. Prowadzą prywatne śledztwo w sprawie pozarządowego spisku.

Muppety ponownie się jednoczą i dają na scenie popis swoich talentów, by uzbierać środki niezbędne do uratowania starego teatru.

Agent J przywraca byłemu partnerowi pamięć, by ten pomógł mu powstrzymać najeźdźcę z kosmosu.