Nastoletni Jason za pomocą tajemniczej laski przenosi się do baśniowej krainy w starożytnych Chinach, gdzie otrzymuje misję ratowania świata.

Po latach odosobnienia z powodu utraty córki oraz matki Huo Yuan Jia wraca do rodzinnego miasteczka rządzonego przez Europejczyków.

Zbuntowany program Smith rozpoczyna przejmowanie kontroli w Matrixie, a armia maszyn zbliża się do Syjonu. Jedyną nadzieją na ratunek jest Neo.

Maszyny chcą zniszczyć Syjon. Neo wyrusza z misją ocalenia ostatniego miasta ludzi.