Film rozgrywa się w odległej przyszłości, kiedy to tajemnicza choroba uśmierciła większą część ludności. Aeon Flux ma zabić jednego z głównych członków Kongresu rządzącego Bregną.

Markiz de Sade trafia do zakładu dla obłąkanych. Próbuje obejść zakaz publikowania, potajemnie wysyłając wydawcom swoje rękopisy.